No se cual es la razón de cortalo, ya nos contaras, pero lo que si esta claro es que algo puede afectar y maxime en el medio marino sobre todo por tema de corrosión.
Mi experiencia como radioaficionado me dice que si puedes no lo cortes ya que siempre es una fuente de problemas, te digo mas, anteriormente a la glomex tenia otra antena que al taladrar una cosa, me lleve por delante parte del aislamiento del cable coaxial (nunca llegue a seccionarlo del todo)y por mucho que lo aisle y demas, me subio un pelin las estacionarias.Al final tuve que cambiar la antena nueva.
Te aconsejo que metas el cable entero, aunque tengas que hacer instalacion nueva y si no tienes mas remedio que cortar, utiliza para unir dos conectores PL uno macho y otro hembra, a posteriori aisla la union como bien te ha dicho el compañero con termoretractil o algo similar.
Espero haberte ayudado y suerte.