Muy bien explicado nauticagandia, asi es hay aparatos de medida, con los que si puedes comprobar el amperaje de la bateria, pero si no se es profesional la compra del mismo sale cara y no merece la pena, yo tengo uno para mi trabajo y sale por unos 150€ el comprobador.
pepelugo, tengas como tengas las baterias, el voltaje con el que trabajas es de 12V normalmente, con el motor parado, tendrias que poner el seleccionador de baterias en la posicion 1 y ver el voltaje que te marca, de hay a posicion 2 y ver que te marca, lo normal es que esten cerca de los 13V, pero eso no indica que tenga amperaje para poder arrancar el motor, igual tienes la bateria/as con algun pequeño defecto (vasos comunidados) y no te va a dar amperaje, por lo que no tendras potencia electrica para arrancar el motor.
Si las baterias que llevas te van bien no cambies de amperaje, cuanto mas amperaje mas va a tardar el alternador en cargar y si no mueves mucho el barco, se te van a descargar igual.