Hola a todos.
Las cajas de las baterías hay que ventilarlas SIEMPRE: las baterías desprenden hidrógeno, muuuuuy inflamable.
Respecto al sistema para cargar dos baterías simultaneamente y que a la vez que estas alimenten de forma independiente el motor y los accesorios, para mí sólo hay dos sistemas eficaces, y ninguno de ellos es tener únicamente el famoso selector 0,1, 2, 1+2:
1. Poner un relé de carga. Cuando el relé detecta tensión del alternador del motor (o del cargador de baterías), pone las dos baterías en paralelo para que el alternador/cargador las cargue simultáneamente; cuando apagas el motor, las separa. La ventaja, que es sencillo, económico y eficaz; el inconveniente, que las baterías están en paralelo mientras hay carga, y una avería grave en una batería te puede tirar abajo la otra (es raro, pero puede pasar).
2. Poner un separador de baterías mediante diodos. Las baterías están eléctricamente separadas siempre, en carga con el alternador/cargador o en descarga. La ventaja, que es el mejor sistema. El inconveniente, que si no te gastas un pastón en un separador con diodos de baja caída de tensión (unos 0,2 voltios), como la caída tipica de tensión de los diodos de los separadores económicos es de 0,5-0,7 voltios, el regulador de carga del motor "verá" que las baterías están cargadas antes de que realmente lo estén, con lo que nunca se cargarán del todo. Una batería cargada 0,5 voltios por debajo de su tensión máxima, está con una carga aproximada del 75%.
Si esto se complementa con uno o dos selectores 0,1,2,1+2 mucho mejor.
Xilquerin, el montaje tal como lo cuentas no está bien, y has hecho un cortocircuito con tu instalación (cambia de electricista ). El negativo nunca se conecta al selector, sino al "punto" que distribuye las masas del barco, que puede estar en el bloque del motor (si es intraborda) o ser independiente. La conexión correcta del negativo es un cable del borne (-) de la batería 1 al borne (-) de la batería 2, y de ésta al bus de masas (poner un cable del borne negativo 1 al bus de masas, y un cable del borne negativo 2 al bus, no es correcto). El cortocircuito ha provocado un aumento de temperatura brutal en los cables de la instalación eléctrica, que se ha llevado por delante algunos fusibles. ¿Cuánto tiempo tuviste conectado el selector? De esto va a depender que sólo hayas quemado los fusibles, o también hayas dañado desde la batería hasta los cables de la instalación, y quién sabe si algo más. Espero que no haya sido muy grave el estropicio.
Saludos.