Hola,
En mi caso estudié por libre el correspondiente libro, al final es memorizar y entender. En el caso de las cartas náuticas, si hay algún problema para entenderlas seguro que encontráis a alguien para ayudaros, realmente es sencillo.
En cuanto a las prácticas, yo las hice por escuela náutica en plan vacaciones (fin de semana en cabrera). Hay otra opción, pero para ello has de disponer de embarcación y pasar el correspondiente examen.
Dicho esto, añadir que ni idea acerca de las escuelas náuticas online :-)
Espero que os sirva de ayuda.